Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A11Q9NSA0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms