Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM7SF3Q9NS93 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms