Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHK2Q9NRA0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHK2Q9NRA0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHK2Q9NRA0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHK2Q9NRA0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHK2Q9NRA0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPHK2Q9NRA0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPHK2Q9NRA0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms