Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGEF3Q9NR81 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGEF3Q9NR81 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGEF3Q9NR81 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGEF3Q9NR81 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGEF3Q9NR81 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGEF3Q9NR81 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGEF3Q9NR81 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGEF3Q9NR81 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF3Q9NR81 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF3Q9NR81 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms