Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX7

ITM2C, Integral membrane protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2CQ9NQX7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITM2CQ9NQX7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms