Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 PTK2-231ENST00000521332 630 ntTSL 414.98□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 PTK2-254ENST00000524040 475 ntTSL 214.98□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 PTK2-219ENST00000520045 602 ntTSL 414.11□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 HNRNPK-206ENST00000457156 1283 ntTSL 514.03□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 PTK2-256ENST00000524257 430 ntTSL 48.37□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 PTK2-234ENST00000521791 556 ntTSL 48.37□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 HNRNPK-205ENST00000376281 2928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 PTK2-214ENST00000519635 578 ntTSL 47.59□□□□□ -1.192e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 PTK2-252ENST00000523803 750 ntTSL 37.24□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 PTK2-223ENST00000520828 574 ntTSL 46.88□□□□□ -1.312e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.341e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 PTK2-205ENST00000517453 571 ntTSL 46.32□□□□□ -1.42e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 PTK2-242ENST00000523067 488 ntTSL 46.23□□□□□ -1.412e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.441e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 PTK2-235ENST00000521907 542 ntTSL 46.04□□□□□ -1.442e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 PTK2-249ENST00000523679 504 ntTSL 35.97□□□□□ -1.452e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.511e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 HNRNPK-207ENST00000472778 822 ntTSL 35.3□□□□□ -1.561e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 HNRNPK-209ENST00000483135 900 ntTSL 25.3□□□□□ -1.561e-6■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 02e-7■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 DNAJB6-208ENST00000441561 1022 ntTSL 513.12□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 DNAJB6-211ENST00000459889 7992 ntTSL 1 (best)12.67□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 DNAJB6-202ENST00000412557 506 ntTSL 39.22□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 DNAJB6-207ENST00000441291 614 ntTSL 39.14□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 DNAJB6-203ENST00000417758 852 ntTSL 58.95□□□□□ -0.982e-7■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD11-211ENST00000566973 442 ntTSL 216.64■□□□□ 0.255e-7■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD11-215ENST00000568512 294 ntTSL 27.72□□□□□ -1.176e-7■■■■■ 36.1
EXOSC5Q9NQT4 ANO10-209ENST00000436073 497 ntTSL 412.78□□□□□ -0.367e-7■■■■■ 36
EXOSC5Q9NQT4 ANO10-208ENST00000428831 641 ntTSL 512.68□□□□□ -0.387e-7■■■■■ 36
EXOSC5Q9NQT4 ANO10-217ENST00000495772 631 ntTSL 39.56□□□□□ -0.887e-7■■■■■ 36
EXOSC5Q9NQT4 ANO10-204ENST00000413397 511 ntTSL 44.36□□□□□ -1.717e-7■■■■■ 36
EXOSC5Q9NQT4 ANO10-210ENST00000439141 560 ntTSL 44.04□□□□□ -1.767e-7■■■■■ 36
EXOSC5Q9NQT4 AFDN-221ENST00000511637 5999 ntTSL 1 (best)9.33□□□□□ -0.924e-8■■■■■ 35.9
EXOSC5Q9NQT4 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.653e-28■■■■■ 35.9
EXOSC5Q9NQT4 C7orf55-LUC7L2-201ENST00000541515 1661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.013e-28■■■■■ 35.9
EXOSC5Q9NQT4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.269e-8■■■■■ 35.8
EXOSC5Q9NQT4 TSC1-208ENST00000545250 8310 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.019e-8■■■■■ 35.8
EXOSC5Q9NQT4 TSC1-207ENST00000493467 2219 ntTSL 1 (best)8.56□□□□□ -1.049e-8■■■■■ 35.8
EXOSC5Q9NQT4 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.269e-8■■■■■ 35.8
EXOSC5Q9NQT4 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.279e-8■■■■■ 35.8
EXOSC5Q9NQT4 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.589e-7■■■■■ 35.8
EXOSC5Q9NQT4 NCOA1-208ENST00000483904 711 ntTSL 35.64□□□□□ -1.511e-9■■■■■ 35.7
EXOSC5Q9NQT4 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.61e-9■■■■■ 35.7
EXOSC5Q9NQT4 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.731e-9■■■■■ 35.7
EXOSC5Q9NQT4 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.81e-9■■■■■ 35.7
EXOSC5Q9NQT4 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81e-9■■■■■ 35.7
EXOSC5Q9NQT4 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 35.7
EXOSC5Q9NQT4 ULBP3-202ENST00000438272 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.141e-7■■■■■ 35.7
EXOSC5Q9NQT4 CEP290-205ENST00000550962 697 ntTSL 310.56□□□□□ -0.721e-9■■■■■ 35.7
EXOSC5Q9NQT4 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.241e-9■■■■■ 35.7
EXOSC5Q9NQT4 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.411e-9■■■■■ 35.7
EXOSC5Q9NQT4 LINC01482-202ENST00000587999 591 ntTSL 35.39□□□□□ -1.552e-9■■■■■ 35.7
EXOSC5Q9NQT4 CEP290-206ENST00000552770 1285 ntTSL 34.14□□□□□ -1.751e-9■■■■■ 35.7
EXOSC5Q9NQT4 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.972e-9■■■■■ 35.7
EXOSC5Q9NQT4 CEP290-204ENST00000547926 2122 ntTSL 1 (best)1.99□□□□□ -2.091e-9■■■■■ 35.7
EXOSC5Q9NQT4 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.231e-9■■■■■ 35.7
EXOSC5Q9NQT4 NSMCE2-201ENST00000287437 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -13e-8■■■■■ 35.7
EXOSC5Q9NQT4 NSMCE2-203ENST00000517532 841 ntTSL 57.62□□□□□ -1.193e-8■■■■■ 35.7
EXOSC5Q9NQT4 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.63e-8■■■■■ 35.7
EXOSC5Q9NQT4 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.643e-8■■■■■ 35.7
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EXOSC5Q9NQT4 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 35.7
EXOSC5Q9NQT4 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.182e-7■■■■■ 35.7
EXOSC5Q9NQT4 PCM1-215ENST00000522275 2379 ntTSL 24.39□□□□□ -1.712e-7■■■■■ 35.7
EXOSC5Q9NQT4 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.032e-7■■■■■ 35.7
EXOSC5Q9NQT4 ZNF430-202ENST00000594110 536 ntTSL 410.28□□□□□ -0.763e-7■■■■■ 35.7
EXOSC5Q9NQT4 ZNF430-206ENST00000599548 595 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.063e-7■■■■■ 35.7
EXOSC5Q9NQT4 ZNF430-201ENST00000261560 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.373e-7■■■■■ 35.7
EXOSC5Q9NQT4 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 35.6
EXOSC5Q9NQT4 AC109466.1-201ENST00000517508 804 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 35.6
EXOSC5Q9NQT4 AC109466.1-206ENST00000522686 774 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.11e-6■■■■■ 35.6
EXOSC5Q9NQT4 AC109466.1-203ENST00000524297 1083 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 35.6
EXOSC5Q9NQT4 AC109466.1-208ENST00000522646 548 ntTSL 35.66□□□□□ -1.51e-6■■■■■ 35.6
EXOSC5Q9NQT4 AC109466.1-207ENST00000522303 526 ntTSL 54.83□□□□□ -1.641e-6■■■■■ 35.6
EXOSC5Q9NQT4 AC109466.1-205ENST00000523704 408 ntTSL 34.68□□□□□ -1.661e-6■■■■■ 35.6
EXOSC5Q9NQT4 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.671e-6■■■■■ 35.6
EXOSC5Q9NQT4 AC109466.1-210ENST00000519329 541 ntTSL 34.4□□□□□ -1.711e-6■■■■■ 35.6
EXOSC5Q9NQT4 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.791e-6■■■■■ 35.6
EXOSC5Q9NQT4 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.344e-7■■■■■ 35.6
EXOSC5Q9NQT4 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.674e-7■■■■■ 35.6
EXOSC5Q9NQT4 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.674e-7■■■■■ 35.6
EXOSC5Q9NQT4 P4HA1-203ENST00000373008 2727 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.954e-7■■■■■ 35.6
EXOSC5Q9NQT4 P4HA1-202ENST00000307116 2727 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.954e-7■■■■■ 35.6
EXOSC5Q9NQT4 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.445e-7■■■■■ 35.5
EXOSC5Q9NQT4 ZNF100-203ENST00000594401 548 ntTSL 45.5□□□□□ -1.535e-7■■■■■ 35.5
EXOSC5Q9NQT4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.127e-7■■■■■ 35.5
EXOSC5Q9NQT4 RPAP3-201ENST00000005386 4370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.947e-7■■■■■ 35.5
EXOSC5Q9NQT4 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.97e-7■■■■■ 35.5
EXOSC5Q9NQT4 SIN3B-207ENST00000595900 563 ntTSL 49.08□□□□□ -0.969e-8■■■■■ 35.5
EXOSC5Q9NQT4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 35.4
EXOSC5Q9NQT4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 35.4
EXOSC5Q9NQT4 FOXN3-204ENST00000553840 555 ntTSL 413.77□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 35.4
EXOSC5Q9NQT4 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 35.4
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