Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ1

MKKS, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKKSQ9NPJ1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKKSQ9NPJ1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKKSQ9NPJ1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms