Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLMQ9NP87 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLMQ9NP87 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms