Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE7BQ9NP56 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE7BQ9NP56 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE7BQ9NP56 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE7BQ9NP56 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE7BQ9NP56 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE7BQ9NP56 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE7BQ9NP56 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE7BQ9NP56 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE7BQ9NP56 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE7BQ9NP56 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE7BQ9NP56 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE7BQ9NP56 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE7BQ9NP56 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE7BQ9NP56 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE7BQ9NP56 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE7BQ9NP56 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms