Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC4Q9HBW1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC4Q9HBW1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC4Q9HBW1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC4Q9HBW1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC4Q9HBW1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC4Q9HBW1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4Q9HBW1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4Q9HBW1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4Q9HBW1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4Q9HBW1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4Q9HBW1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4Q9HBW1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4Q9HBW1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4Q9HBW1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4Q9HBW1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4Q9HBW1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4Q9HBW1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC4Q9HBW1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC4Q9HBW1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC4Q9HBW1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC4Q9HBW1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC4Q9HBW1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC4Q9HBW1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC4Q9HBW1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC4Q9HBW1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC4Q9HBW1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC4Q9HBW1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms