Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC86Q9H6F5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC86Q9H6F5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC86Q9H6F5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC86Q9H6F5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC86Q9H6F5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC86Q9H6F5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC86Q9H6F5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC86Q9H6F5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms