Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STN1Q9H668 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
STN1Q9H668 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STN1Q9H668 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STN1Q9H668 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STN1Q9H668 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STN1Q9H668 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
STN1Q9H668 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
STN1Q9H668 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STN1Q9H668 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STN1Q9H668 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STN1Q9H668 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
STN1Q9H668 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STN1Q9H668 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STN1Q9H668 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms