Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN3Q9H3W5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRN3Q9H3W5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms