Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1Y3

OPN3, Opsin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3Q9H1Y3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OPN3Q9H1Y3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPN3Q9H1Y3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.32■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.32■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.32■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OPN3Q9H1Y3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms