Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E3

SAP130, Histone deacetylase complex subunit SAP130, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP130Q9H0E3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAP130Q9H0E3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SAP130Q9H0E3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAP130Q9H0E3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAP130Q9H0E3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAP130Q9H0E3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAP130Q9H0E3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SAP130Q9H0E3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SAP130Q9H0E3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAP130Q9H0E3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAP130Q9H0E3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAP130Q9H0E3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAP130Q9H0E3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAP130Q9H0E3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAP130Q9H0E3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAP130Q9H0E3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAP130Q9H0E3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAP130Q9H0E3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SAP130Q9H0E3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAP130Q9H0E3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAP130Q9H0E3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAP130Q9H0E3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAP130Q9H0E3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms