Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE2OQ9C0C9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
UBE2OQ9C0C9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE2OQ9C0C9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE2OQ9C0C9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE2OQ9C0C9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE2OQ9C0C9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE2OQ9C0C9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE2OQ9C0C9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE2OQ9C0C9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE2OQ9C0C9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE2OQ9C0C9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE2OQ9C0C9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE2OQ9C0C9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE2OQ9C0C9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
UBE2OQ9C0C9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBE2OQ9C0C9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBE2OQ9C0C9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBE2OQ9C0C9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBE2OQ9C0C9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBE2OQ9C0C9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBE2OQ9C0C9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBE2OQ9C0C9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBE2OQ9C0C9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
UBE2OQ9C0C9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
UBE2OQ9C0C9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE2OQ9C0C9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms