Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SETD2Q9BYW2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms