Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
KDM5DQ9BY66 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
KDM5DQ9BY66 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
KDM5DQ9BY66 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
KDM5DQ9BY66 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
KDM5DQ9BY66 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
KDM5DQ9BY66 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
KDM5DQ9BY66 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
KDM5DQ9BY66 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
KDM5DQ9BY66 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
KDM5DQ9BY66 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
KDM5DQ9BY66 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
KDM5DQ9BY66 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
KDM5DQ9BY66 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
KDM5DQ9BY66 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
KDM5DQ9BY66 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
KDM5DQ9BY66 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
KDM5DQ9BY66 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
KDM5DQ9BY66 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
KDM5DQ9BY66 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
KDM5DQ9BY66 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
KDM5DQ9BY66 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
KDM5DQ9BY66 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
KDM5DQ9BY66 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.32■■■■□ 3.4
KDM5DQ9BY66 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
KDM5DQ9BY66 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
KDM5DQ9BY66 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
KDM5DQ9BY66 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
KDM5DQ9BY66 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
KDM5DQ9BY66 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
KDM5DQ9BY66 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
KDM5DQ9BY66 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
KDM5DQ9BY66 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
KDM5DQ9BY66 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
KDM5DQ9BY66 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
KDM5DQ9BY66 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
KDM5DQ9BY66 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
KDM5DQ9BY66 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
KDM5DQ9BY66 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
KDM5DQ9BY66 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
KDM5DQ9BY66 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
KDM5DQ9BY66 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
KDM5DQ9BY66 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
KDM5DQ9BY66 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
KDM5DQ9BY66 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
KDM5DQ9BY66 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
KDM5DQ9BY66 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
KDM5DQ9BY66 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
KDM5DQ9BY66 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
KDM5DQ9BY66 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.23■■■■□ 3.39
KDM5DQ9BY66 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
KDM5DQ9BY66 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
KDM5DQ9BY66 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
KDM5DQ9BY66 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
KDM5DQ9BY66 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
KDM5DQ9BY66 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
KDM5DQ9BY66 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
KDM5DQ9BY66 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
KDM5DQ9BY66 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
KDM5DQ9BY66 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
KDM5DQ9BY66 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
KDM5DQ9BY66 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
KDM5DQ9BY66 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
KDM5DQ9BY66 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms