Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDC1Q9BTX1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDC1Q9BTX1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 281.2 ms