Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PAGR1Q9BTK6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAGR1Q9BTK6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PAGR1Q9BTK6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PAGR1Q9BTK6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PAGR1Q9BTK6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PAGR1Q9BTK6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PAGR1Q9BTK6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAGR1Q9BTK6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAGR1Q9BTK6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PAGR1Q9BTK6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PAGR1Q9BTK6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAGR1Q9BTK6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAGR1Q9BTK6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAGR1Q9BTK6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAGR1Q9BTK6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAGR1Q9BTK6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.2 ms