Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRADC1Q9BSG0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRADC1Q9BSG0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms