Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP7

FDXACB1, Ferredoxin-fold anticodon-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDXACB1Q9BRP7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FDXACB1Q9BRP7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FDXACB1Q9BRP7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FDXACB1Q9BRP7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FDXACB1Q9BRP7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FDXACB1Q9BRP7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FDXACB1Q9BRP7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FDXACB1Q9BRP7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FDXACB1Q9BRP7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FDXACB1Q9BRP7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FDXACB1Q9BRP7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FDXACB1Q9BRP7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FDXACB1Q9BRP7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FDXACB1Q9BRP7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FDXACB1Q9BRP7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FDXACB1Q9BRP7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FDXACB1Q9BRP7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FDXACB1Q9BRP7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FDXACB1Q9BRP7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FDXACB1Q9BRP7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FDXACB1Q9BRP7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FDXACB1Q9BRP7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FDXACB1Q9BRP7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FDXACB1Q9BRP7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FDXACB1Q9BRP7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FDXACB1Q9BRP7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
FDXACB1Q9BRP7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FDXACB1Q9BRP7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FDXACB1Q9BRP7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FDXACB1Q9BRP7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FDXACB1Q9BRP7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FDXACB1Q9BRP7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms