Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD9AQ99638 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD9AQ99638 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD9AQ99638 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD9AQ99638 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD9AQ99638 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD9AQ99638 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD9AQ99638 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD9AQ99638 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD9AQ99638 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD9AQ99638 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD9AQ99638 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD9AQ99638 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD9AQ99638 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAD9AQ99638 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD9AQ99638 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD9AQ99638 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD9AQ99638 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD9AQ99638 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD9AQ99638 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD9AQ99638 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD9AQ99638 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD9AQ99638 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD9AQ99638 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms