Protein–RNA interactions for Protein: Q99614

TTC1, Tetratricopeptide repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC1Q99614 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC1Q99614 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC1Q99614 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC1Q99614 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC1Q99614 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC1Q99614 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC1Q99614 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC1Q99614 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC1Q99614 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC1Q99614 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC1Q99614 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC1Q99614 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC1Q99614 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC1Q99614 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC1Q99614 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC1Q99614 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC1Q99614 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC1Q99614 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC1Q99614 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC1Q99614 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC1Q99614 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC1Q99614 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms