Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PIK3R4Q99570 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PIK3R4Q99570 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PIK3R4Q99570 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PIK3R4Q99570 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PIK3R4Q99570 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PIK3R4Q99570 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PIK3R4Q99570 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PIK3R4Q99570 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PIK3R4Q99570 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PIK3R4Q99570 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
PIK3R4Q99570 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PIK3R4Q99570 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PIK3R4Q99570 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
PIK3R4Q99570 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PIK3R4Q99570 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PIK3R4Q99570 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PIK3R4Q99570 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PIK3R4Q99570 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PIK3R4Q99570 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PIK3R4Q99570 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PIK3R4Q99570 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PIK3R4Q99570 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PIK3R4Q99570 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PIK3R4Q99570 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PIK3R4Q99570 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PIK3R4Q99570 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
PIK3R4Q99570 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PIK3R4Q99570 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PIK3R4Q99570 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PIK3R4Q99570 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PIK3R4Q99570 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PIK3R4Q99570 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PIK3R4Q99570 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PIK3R4Q99570 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PIK3R4Q99570 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PIK3R4Q99570 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PIK3R4Q99570 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PIK3R4Q99570 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PIK3R4Q99570 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PIK3R4Q99570 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PIK3R4Q99570 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PIK3R4Q99570 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PIK3R4Q99570 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PIK3R4Q99570 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PIK3R4Q99570 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PIK3R4Q99570 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PIK3R4Q99570 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PIK3R4Q99570 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PIK3R4Q99570 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PIK3R4Q99570 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PIK3R4Q99570 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PIK3R4Q99570 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PIK3R4Q99570 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PIK3R4Q99570 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PIK3R4Q99570 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PIK3R4Q99570 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PIK3R4Q99570 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PIK3R4Q99570 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PIK3R4Q99570 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PIK3R4Q99570 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PIK3R4Q99570 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PIK3R4Q99570 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PIK3R4Q99570 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PIK3R4Q99570 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PIK3R4Q99570 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PIK3R4Q99570 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms