Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDRT15Q96T59 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDRT15Q96T59 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDRT15Q96T59 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDRT15Q96T59 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDRT15Q96T59 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDRT15Q96T59 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDRT15Q96T59 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDRT15Q96T59 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDRT15Q96T59 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDRT15Q96T59 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDRT15Q96T59 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDRT15Q96T59 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDRT15Q96T59 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDRT15Q96T59 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDRT15Q96T59 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms