Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC22A12Q96S37 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC22A12Q96S37 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC22A12Q96S37 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC22A12Q96S37 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC22A12Q96S37 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC22A12Q96S37 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC22A12Q96S37 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC22A12Q96S37 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC22A12Q96S37 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC22A12Q96S37 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC22A12Q96S37 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC22A12Q96S37 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC22A12Q96S37 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC22A12Q96S37 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC22A12Q96S37 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC22A12Q96S37 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC22A12Q96S37 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC22A12Q96S37 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC22A12Q96S37 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC22A12Q96S37 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC22A12Q96S37 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC22A12Q96S37 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC22A12Q96S37 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC22A12Q96S37 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC22A12Q96S37 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC22A12Q96S37 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC22A12Q96S37 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC22A12Q96S37 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms