Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC9Q96Q05 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms