Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT3

PRICKLE1, Prickle-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE1Q96MT3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRICKLE1Q96MT3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRICKLE1Q96MT3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRICKLE1Q96MT3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRICKLE1Q96MT3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRICKLE1Q96MT3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRICKLE1Q96MT3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRICKLE1Q96MT3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRICKLE1Q96MT3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRICKLE1Q96MT3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRICKLE1Q96MT3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRICKLE1Q96MT3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRICKLE1Q96MT3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRICKLE1Q96MT3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRICKLE1Q96MT3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRICKLE1Q96MT3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRICKLE1Q96MT3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRICKLE1Q96MT3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRICKLE1Q96MT3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRICKLE1Q96MT3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRICKLE1Q96MT3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRICKLE1Q96MT3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRICKLE1Q96MT3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRICKLE1Q96MT3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRICKLE1Q96MT3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRICKLE1Q96MT3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms