Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD2

C12orf66, KICSTOR complex protein C12orf66, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf66Q96MD2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C12orf66Q96MD2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C12orf66Q96MD2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C12orf66Q96MD2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C12orf66Q96MD2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C12orf66Q96MD2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C12orf66Q96MD2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms