Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD3Q96L08 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUSD3Q96L08 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUSD3Q96L08 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUSD3Q96L08 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUSD3Q96L08 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUSD3Q96L08 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SUSD3Q96L08 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUSD3Q96L08 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUSD3Q96L08 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SUSD3Q96L08 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SUSD3Q96L08 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SUSD3Q96L08 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUSD3Q96L08 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUSD3Q96L08 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms