Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNIP3Q96KP6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNIP3Q96KP6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms