Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM71F1Q96KD3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM71F1Q96KD3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms