Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX11Q96FC9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
DDX11Q96FC9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms