Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12AQ96EY5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MVB12AQ96EY5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms