Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3CQ96E17 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB3CQ96E17 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3CQ96E17 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms