Protein–RNA interactions for Protein: Q96BH1

RNF25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF25Q96BH1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF25Q96BH1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF25Q96BH1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF25Q96BH1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms