Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2A3Q93084 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP2A3Q93084 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms