Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB24

RIN3, Ras and Rab interactor 3, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3Q8TB24 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RIN3Q8TB24 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIN3Q8TB24 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms