Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY6

ZFP28, Zinc finger protein 28 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP28Q8NHY6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZFP28Q8NHY6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZFP28Q8NHY6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZFP28Q8NHY6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZFP28Q8NHY6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZFP28Q8NHY6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZFP28Q8NHY6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZFP28Q8NHY6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZFP28Q8NHY6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZFP28Q8NHY6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZFP28Q8NHY6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFP28Q8NHY6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFP28Q8NHY6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFP28Q8NHY6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFP28Q8NHY6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFP28Q8NHY6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZFP28Q8NHY6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZFP28Q8NHY6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZFP28Q8NHY6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZFP28Q8NHY6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFP28Q8NHY6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZFP28Q8NHY6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms