Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HELBQ8NG08 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
HELBQ8NG08 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HELBQ8NG08 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HELBQ8NG08 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HELBQ8NG08 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HELBQ8NG08 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HELBQ8NG08 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HELBQ8NG08 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HELBQ8NG08 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HELBQ8NG08 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HELBQ8NG08 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HELBQ8NG08 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HELBQ8NG08 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
HELBQ8NG08 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HELBQ8NG08 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HELBQ8NG08 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms