Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD4

Uncharacterized protein FLJ76381, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8NFD4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q8NFD4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q8NFD4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q8NFD4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q8NFD4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q8NFD4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Q8NFD4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q8NFD4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q8NFD4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q8NFD4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q8NFD4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q8NFD4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q8NFD4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q8NFD4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q8NFD4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q8NFD4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Q8NFD4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q8NFD4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q8NFD4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q8NFD4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q8NFD4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q8NFD4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q8NFD4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q8NFD4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q8NFD4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q8NFD4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q8NFD4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q8NFD4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q8NFD4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q8NFD4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q8NFD4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8NFD4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8NFD4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8NFD4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8NFD4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8NFD4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8NFD4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8NFD4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8NFD4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8NFD4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8NFD4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8NFD4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8NFD4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8NFD4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8NFD4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8NFD4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8NFD4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8NFD4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8NFD4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8NFD4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8NFD4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8NFD4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8NFD4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8NFD4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8NFD4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8NFD4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8NFD4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8NFD4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8NFD4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8NFD4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8NFD4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8NFD4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8NFD4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8NFD4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8NFD4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8NFD4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8NFD4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8NFD4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8NFD4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8NFD4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8NFD4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8NFD4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q8NFD4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q8NFD4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q8NFD4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q8NFD4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q8NFD4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8NFD4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8NFD4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8NFD4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8NFD4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8NFD4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8NFD4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8NFD4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8NFD4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8NFD4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8NFD4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8NFD4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8NFD4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8NFD4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8NFD4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8NFD4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8NFD4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8NFD4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8NFD4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8NFD4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8NFD4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8NFD4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8NFD4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8NFD4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms