Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC29Q8NA56 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC29Q8NA56 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms