Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHCHD4Q8N4Q1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHCHD4Q8N4Q1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms