Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC13Q8IYE1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC13Q8IYE1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms