Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU89

CERS3, Ceramide synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS3Q8IU89 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CERS3Q8IU89 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CERS3Q8IU89 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CERS3Q8IU89 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CERS3Q8IU89 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CERS3Q8IU89 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CERS3Q8IU89 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CERS3Q8IU89 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CERS3Q8IU89 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CERS3Q8IU89 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CERS3Q8IU89 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CERS3Q8IU89 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CERS3Q8IU89 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CERS3Q8IU89 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CERS3Q8IU89 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CERS3Q8IU89 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CERS3Q8IU89 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CERS3Q8IU89 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CERS3Q8IU89 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CERS3Q8IU89 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.8 ms