Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPRSS6Q8IU80 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPRSS6Q8IU80 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMPRSS6Q8IU80 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMPRSS6Q8IU80 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMPRSS6Q8IU80 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMPRSS6Q8IU80 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMPRSS6Q8IU80 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPRSS6Q8IU80 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPRSS6Q8IU80 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPRSS6Q8IU80 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPRSS6Q8IU80 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPRSS6Q8IU80 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPRSS6Q8IU80 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPRSS6Q8IU80 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms