Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRX1Q86UT6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRX1Q86UT6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRX1Q86UT6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRX1Q86UT6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRX1Q86UT6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRX1Q86UT6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRX1Q86UT6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRX1Q86UT6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRX1Q86UT6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRX1Q86UT6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRX1Q86UT6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRX1Q86UT6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms