Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT9Q86SS6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SYT9Q86SS6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYT9Q86SS6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms