Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CATSPER4Q7RTX7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CATSPER4Q7RTX7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms